希干希纳区的人们为了保护自己不受巨人吞食，特地建造了四周高达五十公尺的城墙，百年来因此过得很平安，但艾连满心向往外面的世界，对宁可像家畜般在墙内苟且偷生的人们感到不以为然，没想到巨人们这一天真的摧毁了城墙，还当着艾连的面吞噬了母亲。
由于巨人的入侵，希干希纳地区的居民生活遭逢巨变，夹杂在悲鸣与怒吼声下，人们不断逃窜，却也无能为力，最后幸存的人搭船逃到罗塞之墙内。 亲眼见到母亲被吞噬的艾连，在汉尼斯的拯救下逃离后，内心燃起熊熊大火，誓言要打倒巨人。
为学会杀巨人最有效的手段“立体机动术”而加入训练兵团的艾连、米卡莎、阿尔敏，在基斯教官的严格训练下，与来自不同出身地和不同观念的同僚们，逐渐建立起同袍感情，但艾连却不如米卡莎等人，在控制姿势训练中失败了。
加入训练兵团三年，在基斯教官的严格训练下，艾连和米卡莎、阿尔敏终于要毕业了，但艾连却发现学会“立体机动术”等杀巨人的技术，竟同时也是让自己远离巨人到安全圈去的技术，因为成绩高的人，将被派到内地的宪兵团里，在国王底下负责维持秩序。
希干希纳区的惨剧发生后五年，艾连又遭遇到当年毁掉玛利亚之墙的巨人，于是立刻发动立体机动装置，想攻击巨人的要害，但巨人却在一阵蒸气中消失无踪。由于城门已被攻破，为预防巨人们的第二波进军，艾连们淮备展开防卫殊死战。